बीज और रोपण सामग्री पर उप-मिशन (एस. एम. एस. पी.) का उद्देश्य प्रमाणित/गुणवत्ता वाले बीज का उत्पादन बढ़ाना, एस. आर. आर. बढ़ाना, खेत में सहेजे गए बीजों की गुणवत्ता में सुधार करना, बीज गुणन श्रृंखला को मजबूत करना, बीज उत्पादन, प्रसंस्करण, परीक्षण आदि में नई तकनीकों और कार्यप्रणाली को बढ़ावा देना है।

इस योजना का उद्देश्य मिट्टी परीक्षण रिपोर्ट के आधार पर मिट्टी में संशोधन करना, निषेचन प्रथाओं में पीएच और पोषक तत्वों की कमी को दूर करना और फसल उत्पादकता को प्रभावित करने वाले सूक्ष्म पोषक तत्वों जैसी महत्वपूर्ण मिट्टी की कमी को दूर करना है। स्वीकृत सब्सिडी का भुगतान इलेक्ट्रॉनिक क्लीयरेंस सिस्टम के माध्यम से किया जाता है।